В течение своей долгой жизни старец Иоанн (в миру Иван Крестьянкин) сделал несколько пророчеств, которые позднее подтвердились. Так, иеромонаху Тихону (Шевкунову), будущему митрополиту Симферопольскому и Крымскому, старец сказал: «Сейчас слушай волю Божью», и дал наставление отправиться в Москву для открытия подворья Печерского монастыря.
Тихон прислушался к совету старца и получил разрешение святейшего патриарха Алексия. Следуя наставлению Иоанна, он отказался от первых двух предложенных храмов и остановил свой выбор на Сретенском монастыре. «В этом монастыре будет делаться дело для всей Церкви», — говорил старец, и его слова сбылись.
«Мы видим это и сегодня: во-первых, Сретенская духовная семинария готовит священников для всей страны. Во-вторых, здесь ведётся масштабная миссионерская работа», — отметил журналист Роман Голованов в интервью «Царьграду».
Одно из известных пророчеств, которое порой трактуют как предсказание, было записано в декабре 2000 года после видений 22 и 23 декабря 1999-го. В записке, хранящейся в келье Псково-Печерского монастыря, старец написал:
«Стой и смотри, что Я допустил для вашего вразумления без внезапной кончины людей. Виновных не ищите, виновных не ищите! Молитесь! Будьте в жизни всегда и во всём осторожны».
Митрополит Тихон (Шевкунов) предположил, что это высказывание могло иметь отношение к будущим испытаниям, включая пандемию COVID-19.
Ранее, в 1988 году в Псково-Печерском монастыре Иоанн Крестьянкин также делал пророчества о России, заявив, что «Русский народ станет священным народом, утренней звездой среди народов».
Архимандрит неоднократно говорил о «последних временах», призывал не бояться конца света и не поддаваться панике, а главное — избегать греха в повседневной жизни.